• مشروع الفرضية مع الشركاء في إطار معلومات علم الأعصاب (NIF) و ORCID حصل على منحة قدرها 3 مليون دولار لمدة 2.2 سنوات من مؤسسة Leona M. and Harry B. Helmsley Charitable Trust لتقديم شرح توضيحي للطب الحيوي. شروح الويب ، أ معيار جديد للملاحظات الرقمية بالإضافة إلى الموارد الموجودة على الإنترنت ، تثبت أنها تحول في مجالات متنوعة من النشر العلمي إلى التعليم ، والحكومة المفتوحة ، والصحافة. سيجلب هذا المشروع هذه التطورات إلى الطب الحيوي ، حيث لديهم القدرة على إحداث تأثير فريد.
يواجه الباحثون في مجال الطب الحيوي مجموعة سريعة النمو من المؤلفات والبيانات ، ومع ذلك فإن استخراج المكونات الفردية والاستشهاد بها ومشاركتها بطريقة رقمية وتفاعلية لا يزال بعيد المنال. لا تزال الإشارات إلى مجموعات البيانات الصغيرة والأشكال المضمنة وكائنات البحث المفهرسة على نطاق واسع (مثل البروتينات والهياكل والأنواع) من الصعب ربطها بالمساهمين أو التعليق ، وتظهر للباحثين واسترجاعها من خلال البحث المفتوح على الويب. ونتيجة لذلك ، يُعيق الباحثون قدرتهم على اكتشاف المعلومات من حولهم والاستفادة منها بشكل فعال.
في عام 2014 ، أنشأ Helmsley Trust منطقة برنامج جديدة ، البنية التحتية للبحوث الطبية الحيوية (BRI) ، لتحسين البنية التحتية للبحث التعاوني والتعاوني في الطب الحيوي. كواحد من أكبر الممولين الخاصين للبحوث الطبية الحيوية في العالم ، فهم يدركون تمامًا أوجه القصور والمثبطات في الطب الحيوي التي تحد من البحث. يسعى مجال البرنامج الجديد هذا إلى إزالة حواجز الطرق للبحث في التعاون حيثما أمكن ذلك من خلال إنشاء واعتماد التقنيات المفتوحة.
هذه المنحة هي واحدة من ثلاث منح قدمها مكتب البرنامج الجديد في جولته الافتتاحية ، إلى جانب جوائز لمختبر موزيلا للعلوم و Sage Bionetworks.
إمكانات الشرح
توفر التعليقات التوضيحية طريقة جديدة قوية للباحثين لتنظيم أفكارهم وملاحظاتهم على محتوى الويب. يمكن مشاركتها واحدًا لواحد ، في مجموعات صغيرة أو علنًا مع متعاونين آخرين حسب الرغبة. يمكن أن تحذر التعليقات التوضيحية بشأن مشكلات الجودة ، أو تقترح تعديلات على التقنيات التجريبية أو توفر ببساطة معلومات أساسية مفيدة.
التطورات الأخيرة مثل المعرفات الجديدة للكائنات البحثية (معرفات موارد البحث، ويعرف أيضًا باسم RRIDs) ، ومعرفات الباحث (ORCID) وجديد معيار شرح الويب المفتوح (W3C) ، تتقارب لزيادة قابلية اكتشاف المعرفة ونقلها وإمكانية تكرار نتائجها والتعاون في مجال البحوث الطبية الحيوية.
بالفعل ، ظهرت ملايين من التعليقات التوضيحية مثل إطار عمل معلومات العلوم العصبية (NIF) في جامعة كاليفورنيا من خلال تجميع الارتباطات بين الأوراق المنشورة وكائنات أو بروتوكولات البحث. تمت مشاركة هذه التعليقات التوضيحية مع خدمات اكتشاف الأدبيات ، مثل PubMed ، لكن لا يزال من الصعب اكتشافها. يؤدي ترحيل هذه الارتباطات إلى نموذج التعليق التوضيحي المفتوح إلى جعلها متاحة لإعادة الاستخدام والاستهلاك والعرض من خلال مجموعة متنوعة من الأساليب ، بما في ذلك العملاء المتوافقون مع المعايير مثل Hypothes.is وغيرها.
التعليقات التوضيحية هي مثال على النموذج الجديد للميكرو أو "النشر النانوي" - إمكانات نشر جديدة تتيح نهجًا أكثر دقة للاتصال البحثي لم يكن ممكنًا حتى الآن. يتيح النشر المصغر نشرًا سريعًا للخبرة ، بما في ذلك تفاصيل حول الجهود المجهضة أو البروتوكولات غير الناجحة. يمكن للرؤية المعززة للتجارب الصغيرة أو التي تُجرى لمرة واحدة وتجارب مقاعد البدلاء أن تشير إلى طرق مثمرة لتعميق الاستقصاء لمن حصلوا على تدريب أو موارد أفضل ، إلى جانب إصدار كميات صغيرة من البيانات والنتائج الإحصائية.
ضم التعليقات التوضيحية مع RRIDs و ORCID يمكن لمعرف الباحث الفريد أن يحول البحث الطبي الحيوي من خلال إنشاء مجموعة متشابكة وقابلة للتشغيل المتبادل من أصول البحث مفتوحة المصدر التي تحقق الدقة في الموقع والإسناد والمراجع.
نظرة عامة على تعاون الشركاء
سوف يتعاون الشركاء لدمج ORCID معرّفات المساهم في التعليقات التوضيحية وفي تدفقات عمل الناشر جنبًا إلى جنب مع RRIDs ، بالإضافة إلى عرض نشاط التعليقات التوضيحية العلمية في ORCID واجهة.
يربط اقتراحنا بين المعرفات والتعليقات التي يحركها الباحث بطريقة نأمل أن تسهل نشاط البحث والمشاركة في المخرجات العلمية بشكل عام. بالإضافة إلى ذلك ، سيمكن هذا الاقتراح من قياس النشاط التوضيحي والاستشهاد به من قبل الباحثين في كائنات البحث العلمي ، مما يجعل من الممكن تضمين مثل هذا النشاط في تقارير الأنشطة البحثية المؤسسية والفردية.
الهدف الرئيسي الأخير من اقتراحنا هو تسهيل اعتماد الشرح بشكل عام في العلوم الحيوية. سيكون النشاط المبكر هو تنظيم وجمع المدخلات من مجموعات المستخدمين والشركاء لفهم احتياجاتهم بشكل أفضل ، وتطوير المخرجات لتلبيتها. نرحب باهتمام الآخرين الذين يرون إمكانات هذه التكنولوجيا ، ونحن حريصون على توحيد الجهود مع المنظمات والأفراد ذوي التفكير المماثل.
عن الشركاء
فرضية
The Hypothes.is Project هي شركة برمجيات غير ربحية مقرها سان فرانسيسكو تركز على تمكين البشر من التفكير بشكل أكثر فعالية معًا من خلال طبقة مناقشة مشتركة وتعاونية على جميع المعارف.
إطار معلومات علم الأعصاب
إطار معلومات علم الأعصاب (NIF) في جامعة كاليفورنيا في سان فرانسيسكو هو مبادرة من NIH Blueprint for Neuroscience Research التي توفر بيئة مفتوحة شبكية يمكن للباحثين استخدامها للبحث في قائمة بمصادر بيانات علم الأعصاب المستندة إلى الويب والمواد البحثية والأدوات. يحتوي NIF على ثلاثة فهارس رئيسية: السجل ، كتالوج يحتوي على 12,000 مورد (بما في ذلك 2500 قاعدة بيانات) ؛ المجموعة الفرعية ذات الوصول المفتوح من خدمات الأدب و PubMed و PubMed Central في المكتبة الوطنية للطب ؛ واتحاد البيانات ، وهو مجموعة من 200 قاعدة بيانات تعرض حوالي 850 مليون سجل بيانات. سيتعاون كل من NIF و Hypothes.is لتطوير الخدمات لعرض أوصاف النص العادي في معيار التعليقات التوضيحية للويب الناشئ. لمزيد من المعلومات حول NIF ، راجع https://www.neuinfo.org/.
ORCID
• ORCID المهمة هي حل مشكلة غموض الاسم في الاتصالات العلمية. تحقيقا لهذه الغاية، ORCID يوفر سجلاً مفتوحًا للمعرفات الفريدة والمستمرة للباحثين ، ويعمل مع المجتمع لضمان جمع هذه المعرفات أثناء سير العمل البحثي وتصبح جزءًا من أعمال وأنشطة البحث. ORCIDتركيزه على مشاركة الباحث ، وتوفير واجهات برمجة التطبيقات المفتوحة ورمز البرنامج ، والتعاون مع منظمات المعايير الأخرى ومبادرات المعرف المستمرة ، بما في ذلك RRID ، يجعل ORCID أداة قوية لربط الباحثين بنشاط التعليقات التوضيحية.
بمساهمات من:
دان والي ، الفرضيات
ماريان مارتون ، جامعة كاليفورنيا
لوريل هاك ORCID
بيتر برانتلي ، NYPL