假設.is項目 與合作夥伴一起 神經科學信息框架 (NIF)和 ORCID 已獲得 Leona M. 和 Harry B. Helmsley 慈善信託基金授予的為期 3 年、價值 2.2 萬美元的資助,為生物醫學帶來註釋。 網頁註釋, 數字筆記的新標準 除了現有的在線資源之外,事實證明,它們在學術出版、教育、開放政府和新聞等各個領域都具有變革性。 該項目將把這些進步帶入生物醫學,它們有可能產生獨特的影響。
生物醫學研究人員面臨著快速增長的文獻和數據,但以數字和交互式方式提取、引用和共享各個組成部分仍然難以實現。 對小數據集、嵌入圖形和廣泛編目的研究對象(例如蛋白質、結構和物種)的引用仍然難以與貢獻者或評論聯繫起來,也很難向研究人員展示並通過開放網絡搜索進行檢索。 因此,研究人員有效發現和利用周圍信息的能力受到阻礙。
2014 年,赫爾姆斯利信託基金創建了一個新的計劃領域, 生物醫學研究基礎設施 (一帶一路),改善生物醫學合作研究的基礎設施。 作為世界上最大的生物醫學研究私人資助者之一,他們敏銳地意識到生物醫學領域的低效率和抑制因素限制了研究。 這個新計劃領域致力於通過創建和採用開放技術來盡可能消除研究合作的障礙。
這筆贈款是新項目辦公室在首輪融資中提供的三筆贈款之一,其他獎項還授予 Mozilla 科學實驗室和 Sage Bionetworks。
註釋的潛力
註釋為研究人員提供了一種強大的新方式來組織他們對網絡內容的想法和註釋。 這些可以根據需要一對一、小組或與其他合作者公開共享。 註釋可以警告質量問題、建議對實驗技術進行修改或只是提供有用的背景信息。
最近的發展,例如研究對象的新標識符(研究資源標識符,又名 RRID),研究人員標識符(ORCID)和一個新的 開放網絡註釋標準 (W3C) 正在匯聚在一起,以提高生物醫學研究中知識的可發現性、轉移、可重複性和協作。
加州大學聖地亞哥分校的神經科學信息框架 (NIF) 等項目已經通過匯總已發表的論文和研究對像或協議之間的關聯來顯示數百萬條註釋。 這些註釋已與 PubMed 等文獻發現服務共享,但它們仍然很難發現。 將這些關聯遷移到開放註釋模型中,使它們可以通過各種方法(包括 Hypothes.is 等符合標準的客戶端)進行重用、使用和顯示。
註釋是微觀或“納米出版”新範式的一個例子,新的出版功能可以實現更精細的研究交流方法,而這在以前是不可能的。 微型出版可以更快速地傳播經驗,包括有關失敗的努力或不成功的方案的詳細信息。 小型或一次性試驗和台架實驗的可見度的提高可以為那些受過更好培訓或資源更豐富的人提供深化調查的有效途徑,同時發布少量數據和統計結果。
將註釋與 RRID 和 ORCID 獨特的研究人員標識符可以通過創建一套互鎖且可互操作的開源研究資產來改變生物醫學研究,從而帶來精確的位置、歸屬和參考。
合作夥伴合作概覽
合作夥伴將合作合併 ORCID 將貢獻者標識符與 RRID 一起添加到註釋和發布者工作流程中,並公開學術註釋活動 ORCID 接口。
我們的提案將標識符和研究人員驅動的評論結合在一起,我們希望能夠促進研究活動和一般學術成果的參與。 此外,該提案將使學術研究對象的研究人員能夠對註釋活動進行測量和引用,從而可以將此類活動納入機構和個人研究活動報告中。
我們提案的最後一個關鍵目標是促進生物科學中普遍採用註釋。 早期的活動將是組織和收集用戶群體和合作夥伴的意見,以更好地了解他們的需求,並開發可交付成果來滿足這些需求。 我們歡迎其他看到這項技術潛力的人感興趣,並渴望與志同道合的組織和個人聯手。
關於合作夥伴
假設
Hypothes.is 項目是一家總部位於舊金山的非營利軟件公司,致力於讓人類通過所有知識的共享、協作討論層更有效地共同推理。
神經科學信息框架
加州大學聖地亞哥分校的神經科學信息框架(NIF) 是NIH 神經科學研究藍圖的一項舉措,它提供了一個開放的網絡環境,研究人員可以使用它來搜索基於網絡的神經科學數據源、研究材料和工具的庫存。 NIF有三個主要索引:註冊表,12,000個資源的目錄(包括2500個數據庫); 國家醫學圖書館的文獻、PubMed 和 PubMed 中心服務的開放獲取子集; 數據聯合,由 200 個數據庫組成,公開約 850 億條數據記錄。 NIF 和 Hypothes.is 將合作開發服務,以在新興的 Web 註釋標準中公開純文本描述。 有關 NIF 的更多信息,請參閱 https://www.neuinfo.org/.
ORCID
ORCID 使命是解決學術交流中的名稱歧義問題。 為此, ORCID 為研究人員提供唯一且持久的標識符的開放註冊表,並與社區合作,確保這些標識符在研究工作流程中被收集並成為研究工作和活動的一部分。 ORCID專注於研究人員參與、提供開放 API 和軟件代碼以及與其他標準組織和持久標識符計劃(包括 RRID)的合作,使得 ORCID 將研究人員與其註釋活動聯繫起來的強大工具。
貢獻者:
丹·威利 (Dan Whaley),Hypothes.is
瑪麗安·馬通,加州大學聖地亞哥分校
勞雷爾·哈克, ORCID
彼得·布蘭特利,紐約公共圖書館