A Projeto Hypothes.is junto com parceiros no Estrutura de Informação em Neurociência (NIF) e ORCID recebeu um subsídio de US $ 3 milhões de 2.2 anos da Leona M. e Harry B. Helmsley Charitable Trust para trazer anotações para a biomedicina. Anotações da web, um novo padrão para notas digitais além de um recurso online existente, estão se mostrando transformadoras em diversos campos, desde a publicação acadêmica até a educação, governo aberto e jornalismo. Este projeto trará esses avanços para a biomedicina, onde têm potencial para causar um impacto único.
Os pesquisadores biomédicos se deparam com um corpo de literatura e dados em rápido crescimento, mas extrair, citar e compartilhar componentes individuais de forma digital e interativa continua difícil de ser alcançado. Referências a pequenos conjuntos de dados, figuras incorporadas e objetos de pesquisa amplamente catalogados (como proteínas, estruturas e espécies) permanecem difíceis de associar a colaboradores ou comentários, aparecer para pesquisadores e recuperar por meio de pesquisa aberta na web. Conseqüentemente, os pesquisadores são prejudicados em sua capacidade de descobrir e alavancar as informações ao seu redor com eficácia.
Em 2014, o Helmsley Trust criou uma nova área de programa, Infraestrutura de pesquisa biomédica (BRI), para melhorar a infraestrutura de pesquisa colaborativa e cooperativa em biomedicina. Como um dos maiores financiadores privados da pesquisa biomédica do mundo, eles estão perfeitamente cientes das ineficiências e desincentivos da biomedicina que limitam a pesquisa. Esta nova área de programa se esforça para remover obstáculos à colaboração de pesquisa, sempre que possível, por meio da criação e adoção de tecnologias abertas.
Esta bolsa é uma das três feitas pelo escritório do novo programa em sua rodada inaugural, junto com prêmios para o Mozilla Science Lab e Sage Bionetworks.
O potencial de anotação
As anotações fornecem uma nova maneira poderosa para os pesquisadores organizarem seus pensamentos e notas sobre o conteúdo da web. Eles podem ser compartilhados individualmente, em pequenos grupos ou publicamente com outros colaboradores, conforme preferir. As anotações podem alertar sobre problemas de qualidade, sugerir modificações em técnicas experimentais ou simplesmente fornecer informações úteis básicas.
Desenvolvimentos recentes, como novos identificadores para objetos de pesquisa (Identificadores de recursos de pesquisa, também conhecido como RRIDs), identificadores de pesquisador (ORCID) e um novo padrão de anotação da web aberta (W3C), estão convergindo para aumentar a descoberta, transferência, reprodutibilidade e colaboração do conhecimento dentro da pesquisa biomédica.
Projetos como o Neuroscience Information Framework (NIF) da UCSD já trouxeram milhões de anotações ao agregar associações entre artigos publicados e objetos ou protocolos de pesquisa. Essas anotações foram compartilhadas com serviços de descoberta de literatura, como o PubMed, mas permanecem difíceis de descobrir. Migrar essas associações para o modelo de anotação aberto torna-as disponíveis para reutilização, consumo e exibição por meio de uma variedade de abordagens, incluindo clientes em conformidade com os padrões, como Hypothes.is e outros.
As anotações são um exemplo do novo paradigma da micro ou “nanopublicação” - novos recursos de publicação que permitem uma abordagem mais granular para a comunicação de pesquisa que não tinha sido possível até agora. A micropublicação permite uma disseminação mais rápida da experiência, incluindo detalhes sobre esforços abortados ou protocolos malsucedidos. A visibilidade aprimorada de ensaios pequenos ou únicos e experimentos de bancada pode sugerir caminhos frutíferos para aprofundar uma investigação para aqueles mais bem treinados ou dotados de recursos, juntamente com a liberação de pequenas quantidades de dados e resultados estatísticos.
Unindo anotações com RRIDs e o ORCID O identificador único do pesquisador pode transformar a pesquisa biomédica, criando um conjunto integrado e interoperável de ativos de pesquisa de código aberto que trazem precisão na localização, atribuição e referência.
Visão geral da colaboração de parceiros
Os parceiros irão colaborar para incorporar ORCID identificadores de contribuidores em anotações e fluxos de trabalho de editores junto com RRIDs, bem como expor atividades de anotações acadêmicas no ORCID interface.
Nossa proposta une identificadores e comentários conduzidos pelo pesquisador de uma forma que esperamos que facilite a atividade de pesquisa e o envolvimento com a produção acadêmica em geral. Além disso, esta proposta possibilitará a mensuração e citação da atividade de anotação por pesquisadores de objetos de pesquisa acadêmica, possibilitando a inclusão dessa atividade em relatórios de atividades de pesquisa institucionais e individuais.
O último objetivo principal de nossa proposta é facilitar a adoção de anotações geralmente nas biociências. Uma atividade inicial será organizar e reunir contribuições de grupos de usuários e parceiros para entender melhor suas necessidades e desenvolver produtos para atendê-las. Agradecemos o interesse de outras pessoas que vêem o potencial desta tecnologia e estão ansiosas para unir forças com organizações e indivíduos com ideias semelhantes.
Sobre os sócios
Hipótese
The Hypothes.is Project é uma empresa de software sem fins lucrativos sediada em San Francisco, focada em capacitar os humanos a raciocinarem juntos de forma mais eficaz por meio de uma camada de discussão colaborativa e compartilhada sobre todo o conhecimento.
A estrutura de informações da neurociência
O Neuroscience Information Framework (NIF) da UCSD é uma iniciativa do NIH Blueprint for Neuroscience Research que fornece um ambiente de rede aberto que os pesquisadores podem usar para pesquisar um inventário de fontes de dados de neurociência baseadas na Web, materiais de pesquisa e ferramentas. O NIF tem três índices principais: o Registro, um catálogo de 12,000 recursos (incluindo 2500 bancos de dados); o subconjunto de acesso aberto dos serviços Literature, PubMed e PubMed Central na National Library of Medicine; e a Federação de Dados, um grupo de 200 bancos de dados que expõe cerca de 850 milhões de registros de dados. NIF e Hypothes.is irão colaborar para desenvolver serviços para expor descrições de texto simples no padrão emergente de anotação da Web. Para obter mais informações sobre NIF, consulte https://www.neuinfo.org/.
ORCID
A ORCID missão é resolver o problema de ambigüidade de nomes nas comunicações acadêmicas. Para este fim, ORCID fornece um registro aberto de identificadores únicos e persistentes para pesquisadores e trabalha com a comunidade para garantir que esses identificadores sejam coletados durante fluxos de trabalho de pesquisa e se tornem parte de trabalhos e atividades de pesquisa. ORCIDO foco da empresa no envolvimento do pesquisador, o fornecimento de APIs abertas e código de software, e colaborações com outras organizações de padrões e iniciativas de identificador persistentes, incluindo RRID, tornam ORCID uma ferramenta poderosa para vincular pesquisadores com sua atividade de anotação.
Com contribuições de:
Dan Whaley, Hipóteses.is
Maryann Martone, UCSD
Laurel Haak, ORCID
Peter Brantley, NYPL
