XNUMXD덴탈의 Hypothes.is 프로젝트 에서 파트너와 함께 신경과학 정보 프레임워크 (NIF) 및 ORCID Leona M.과 Harry B. Helmsley Charitable Trust로부터 3년 동안 2.2만 달러의 보조금을 받아 생물의학에 주석을 추가했습니다. 웹 주석, 디지털 노트의 새로운 기준 기존 온라인 리소스 외에도 학술 출판에서 교육, 열린 정부, 저널리즘에 이르기까지 다양한 분야에서 변혁을 일으키고 있습니다. 이 프로젝트는 고유한 영향을 미칠 수 있는 잠재력이 있는 생물의학에 이러한 발전을 가져올 것입니다.
생의학 연구자들은 빠르게 성장하는 문헌과 데이터에 직면해 있지만 디지털 및 대화형 방식으로 개별 구성 요소를 추출, 인용 및 공유하는 것은 여전히 어렵습니다. 작은 데이터 세트, 포함된 수치, 광범위하게 분류된 연구 개체(예: 단백질, 구조 및 종)에 대한 참조는 기고자 또는 논평과 연결하고 연구자에게 표시하고 공개 웹 검색을 통해 검색하기가 여전히 어렵습니다. 결과적으로 연구자들은 주변 정보를 효과적으로 발견하고 활용하는 능력이 저하됩니다.
2014년에 Helmsley Trust는 새로운 프로그램 영역인 생물 의학 연구 인프라 (BRI), 생물 의학 분야의 협력 및 협력 연구를 위한 인프라를 개선합니다. 세계에서 가장 큰 생물의학 연구 민간 자금 제공자 중 하나인 그들은 연구를 제한하는 생물의학의 비효율성과 의욕을 떨어뜨리는 요소를 잘 알고 있습니다. 이 새로운 프로그램 영역은 개방형 기술의 생성 및 채택을 통해 가능한 경우 연구 협력에 대한 장애물을 제거하기 위해 노력합니다.
이 보조금은 Mozilla Science Lab 및 Sage Bionetworks에 대한 상과 함께 첫 번째 라운드에서 새로운 프로그램 사무소가 만든 세 가지 중 하나입니다.
주석의 잠재력
주석은 연구자가 웹 콘텐츠에 대한 생각과 메모를 정리할 수 있는 강력하고 새로운 방법을 제공합니다. 이들은 일대일로, 소그룹으로 또는 선호하는 다른 공동 작업자와 공개적으로 공유할 수 있습니다. 주석은 품질 문제에 대해 경고하거나 실험 기법에 대한 수정을 제안하거나 단순히 유용한 배경 정보를 제공할 수 있습니다.
연구 대상에 대한 새로운 식별자와 같은 최근 개발(연구 리소스 식별자, 일명 RRID), 연구원 식별자(ORCID) 및 새로운 개방형 웹 주석 표준 (W3C)는 생물 의학 연구 내에서 지식 발견 가능성, 이전, 재현성 및 협업을 향상시키기 위해 수렴하고 있습니다.
이미 UCSD의 신경과학 정보 프레임워크(NIF)와 같은 프로젝트는 출판된 논문과 연구 대상 또는 프로토콜 간의 연관성을 집계하여 수백만 개의 주석을 표면화했습니다. 이러한 주석은 PubMed와 같은 문헌 검색 서비스와 공유되었지만 여전히 검색하기 어렵습니다. 이러한 연결을 개방형 주석 모델로 마이그레이션하면 Hypothes.is 등과 같은 표준 준수 클라이언트를 포함한 다양한 접근 방식을 통해 재사용, 소비 및 표시할 수 있습니다.
주석은 지금까지 불가능했던 연구 커뮤니케이션에 대한 보다 세분화된 접근 방식을 가능하게 하는 새로운 출판 기능인 마이크로 또는 "나노출판"의 새로운 패러다임의 한 예입니다. Micropublishing은 중단된 노력이나 실패한 프로토콜에 대한 세부 정보를 포함하여 경험을 보다 신속하게 보급할 수 있습니다. 소규모 또는 일회성 시험 및 벤치 실험의 향상된 가시성은 적은 양의 데이터 및 통계 결과의 공개와 함께 더 잘 훈련되거나 리소스가 있는 사람들을 위해 조사를 심화할 수 있는 유익한 방법을 제안할 수 있습니다.
RRID 및 ORCID 고유한 연구원 식별자는 위치, 속성 및 참조의 정확성을 제공하는 연동되고 상호 운용 가능한 오픈 소스 연구 자산 세트를 생성하여 생물 의학 연구를 혁신할 수 있습니다.
파트너 협업 개요
파트너는 통합을 위해 협력할 것입니다. ORCID 기여자 식별자를 RRID와 함께 주석 및 게시자 워크플로에 추가하고 학술적 주석 활동을 ORCID 인터페이스.
우리의 제안은 일반적으로 연구 활동과 학술적 결과물에 대한 참여를 촉진하기를 바라는 방식으로 식별자와 연구자 중심의 논평을 결합합니다. 또한 본 제안은 학술 연구 대상 연구자의 주석 활동 측정 및 인용을 가능하게 하여 기관 및 개인 연구 활동 보고에 이러한 활동을 포함시킬 수 있도록 합니다.
우리 제안의 마지막 주요 목표는 생명 과학에서 일반적으로 주석의 채택을 촉진하는 것입니다. 초기 활동은 사용자 그룹과 파트너의 의견을 구성하고 수집하여 요구 사항을 더 잘 이해하고 이를 충족하기 위해 결과물을 발전시키는 것입니다. 우리는 이 기술의 잠재력을 보고 같은 생각을 가진 조직 및 개인과 협력하기를 열망하는 다른 사람들의 관심을 환영합니다.
파트너 정보
가설
The Hypothes.is 프로젝트는 샌프란시스코에 기반을 둔 비영리 소프트웨어 회사로 모든 지식에 대한 공유되고 협력적인 토론 계층을 통해 사람들이 함께 더 효과적으로 추론할 수 있도록 하는 데 중점을 둡니다.
신경과학 정보 프레임워크
UCSD의 신경과학 정보 프레임워크(NIF)는 연구원들이 웹 기반 신경과학 데이터 소스, 연구 자료 및 도구 목록을 검색하는 데 사용할 수 있는 개방형 네트워크 환경을 제공하는 신경과학 연구를 위한 NIH 청사진의 이니셔티브입니다. NIF에는 12,000개의 주요 인덱스가 있습니다. National Library of Medicine의 Literature, PubMed 및 PubMed Central 서비스의 오픈 액세스 하위 집합; 약 2500억 200천만 개의 데이터 레코드를 노출하는 850개의 데이터베이스 그룹인 Data Federation이 있습니다. NIF와 Hypothes.is는 새로운 웹 주석 표준에서 일반 텍스트 설명을 노출하는 서비스를 개발하기 위해 협력할 것입니다. NIF에 대한 자세한 내용은 다음을 참조하십시오. https://www.neuinfo.org/.
ORCID
XNUMXD덴탈의 ORCID 임무는 학술 커뮤니케이션에서 이름 모호성 문제를 해결하는 것입니다. 이를 위해, ORCID 연구원을 위한 고유하고 영구적인 식별자의 공개 레지스트리를 제공하고 커뮤니티와 협력하여 이러한 식별자가 연구 워크플로 중에 수집되고 연구 작업 및 활동의 일부가 되도록 합니다. ORCID연구원 참여, 개방형 API 및 소프트웨어 코드 제공, 다른 표준 조직과의 협력 및 RRID를 포함한 영구 식별자 이니셔티브에 대한 의 초점은 ORCID 주석 활동과 연구원을 연결하는 강력한 도구입니다.
다음의 기여로 :
댄 웨일리, Hypothes.is
메리앤 마톤, UCSD
로렐 하크, ORCID
피터 브랜틀리, NYPL