この Hypothes.is プロジェクト のパートナーと一緒に 神経科学情報フレームワーク (NIF) および ORCID は、生物医学に注釈をもたらすために、レオナ M. およびハリー B. ヘルムスリー慈善信託から 3 年間で 2.2 万ドルの助成金を獲得しました。 Web 注釈、 デジタルノートの新しいスタンダード 既存のオンライン リソースに加えて、学術出版から教育、オープンガバメント、ジャーナリズムに至るまで、さまざまな分野で変革をもたらすことが証明されています。 このプロジェクトはこれらの進歩を生物医学にもたらし、独特の影響を与える可能性を秘めています。
生物医学研究者は、急速に増大する文献やデータに直面していますが、デジタルかつインタラクティブな方法で個々の構成要素を抽出、引用、共有することは依然として困難です。 小規模なデータセット、埋め込まれた図、および広くカタログ化された研究オブジェクト (タンパク質、構造、種など) への参照は、寄稿者や解説者と関連付けることが依然として困難であり、研究者に表面化し、オープン Web 検索を通じて検索することが困難です。 その結果、研究者は周囲の情報を効果的に発見して活用する能力が妨げられています。
2014 年、ヘルムスリー トラストは新しいプログラム領域を創設しました。 生物医学研究インフラ (BRI)、生物医学における共同および協力研究のためのインフラを改善する。 世界最大の生物医学研究への民間資金提供者の一つとして、彼らは研究を制限する生物医学の非効率性と阻害要因を痛感しています。 この新しいプログラム領域は、オープン テクノロジーの創出と導入を通じて、可能な限り研究協力の障害を取り除くことを目指しています。
この助成金は、Mozilla Science Lab と Sage Bionetworks への賞とともに、新しいプログラム オフィスが最初のラウンドで行った XNUMX つの助成金のうちの XNUMX つです。
アノテーションの可能性
注釈は、研究者が Web コンテンツに関する考えやメモを整理するための強力な新しい方法を提供します。 これらは、必要に応じて XNUMX 対 XNUMX、小グループ、または他の共同作業者と公開で共有できます。 注釈は、品質の問題について警告したり、実験手法の変更を提案したり、単に役立つ背景情報を提供したりできます。
研究対象の新しい識別子などの最近の開発 (研究リソース識別子、別名 RRID)、研究者識別子 (ORCID）と新しい オープンウェブアノテーション標準 (W3C) は、生物医学研究における知識の発見可能性、伝達、再現性、コラボレーションを向上させるために集結しています。
すでに、UCSD の神経科学情報フレームワーク (NIF) などのプロジェクトは、出版された論文と研究対象またはプロトコルの間の関連性を集約することによって、数百万の注釈を明らかにしています。 これらの注釈は、PubMed などの文献検索サービスと共有されていますが、依然として発見は困難です。 これらの関連付けをオープン アノテーション モデルに移行すると、Hypothes.is などの標準に準拠したクライアントを含むさまざまなアプローチを通じて、関連付けを再利用、消費、表示できるようになります。
アノテーションは、マイクロまたは「ナノ出版」の新しいパラダイムの一例です。これは、これまで不可能だった、研究コミュニケーションに対するよりきめ細かなアプローチを可能にする新しい出版機能です。 マイクロパブリッシングにより、中止された取り組みや失敗したプロトコルの詳細を含む、経験をより迅速に広めることができます。 小規模または XNUMX 回限りの試験やベンチ実験の可視性が向上すると、少量のデータや統計結果が公開されるとともに、より適切な訓練を受けた人やリソースに恵まれた人にとって調査を深めるための実りある手段が示唆される可能性があります。
注釈を RRID と結合し、 ORCID 固有の研究者識別子は、位置、帰属、および参照の精度をもたらす、連動して相互運用可能なオープンソース研究資産のセットを作成することにより、生物医学研究を変革できます。
パートナー連携の概要
パートナーは協力して組み込みます ORCID 寄稿者識別子を注釈および発行者のワークフローに RRID とともに組み込むだけでなく、学術的な注釈アクティビティを公開します。 ORCID インタフェース。
私たちの提案は、一般に研究活動と学術成果への関与を促進することを期待する方法で、識別子と研究者主導のコメントを組み合わせたものです。 また、本提案により、学術研究対象の研究者によるアノテーション活動の計測・引用が可能となり、機関および個人の研究活動報告にその活動を含めることが可能となります。
私たちの提案の最後の重要な目的は、生物科学全般におけるアノテーションの採用を促進することです。 初期の活動は、ユーザー グループやパートナーからの意見を整理して収集し、ニーズをより深く理解し、それらを満たすために成果物を進化させることです。 私たちは、このテクノロジーの可能性を見出し、志を同じくする組織や個人と協力したいと考えている他の方々の関心を歓迎します。
パートナーについて
仮説
Hypothes.is プロジェクトは、サンフランシスコに本拠を置く非営利ソフトウェア会社で、あらゆる知識にわたる共有された共同ディスカッション層を通じて人間がより効果的に推論できるようにすることに重点を置いています。
神経科学情報フレームワーク
UCSD の神経科学情報フレームワーク (NIF) は、神経科学研究のための NIH ブループリントの取り組みであり、研究者が Web ベースの神経科学データ ソース、研究資料、およびツールの目録を検索するために使用できるオープン ネットワーク環境を提供します。 NIF には 12,000 つの主要なインデックスがあります。2500 つはレジストリ、200 のリソース (850 のデータベースを含む) のカタログです。 国立医学図書館の文献、PubMed、PubMed Central サービスのオープンアクセスのサブセット。 Data Federation は、約 XNUMX 億 XNUMX 万件のデータ レコードを公開する XNUMX のデータベースからなるグループです。 NIF と Hypothes.is は協力して、新たな Web アノテーション標準でプレーン テキストの記述を公開するサービスを開発します。 NIF の詳細については、次を参照してください。 https://www.neuinfo.org/.
ORCID
この ORCID 使命は、学術コミュニケーションにおける名前の曖昧さの問題を解決することです。 この目的を達成するために、 ORCID は、一意で永続的な識別子のオープン レジストリを研究者に提供し、コミュニティと協力して、これらの識別子が研究ワークフロー中に収集され、研究作業や活動の一部となるようにします。 ORCIDは、研究者の関与、オープン API とソフトウェア コードの提供、他の標準化団体とのコラボレーション、および RRID を含む永続的識別子の取り組みに重点を置いているため、 ORCID 研究者と注釈付け活動を結び付けるための強力なツールです。
からの貢献で：
ダン・ホエーリー、Hypothes.is
マリアン・マートン、UCSD
ローレル・ハーク ORCID
ピーター・ブラントリー、NYPL
